基于数学模型的蛋白质超二级结构β-α-β模体预测
日期:2017-12-03 20:40 点击:307
在蛋白质结构中,两个反平行的β折叠片(β-strand)被多肽(loop)连接,并且两个β折叠片之间存在氢键,形成的结构模体β-loop-β称为β发夹(β-hairpin)[1-4]。与之相比,两个平行的β-strand被较长的loop连接,loop中间包含α螺旋(α-helical),并且两个β折叠片之间存在氢键,形成的结构模体β-loop-α-loop-β叫做β-α-β 模体,它是含有平行的β折叠(sheet)的蛋白质中的常见模体[1,5] ,它频繁的出现在每一个具有β折叠片的蛋白质结构中,在蛋白质结构中占有重要地位,对蛋白质的功能有着重要影响。因此,对β-α-β模体的统计分析及预测是十分有意义的。